第1步：考慮進水水源、水質(zhì)，進水和產(chǎn)水流量以及所需的產(chǎn)水水質(zhì)。

    膜系統(tǒng)的設(shè)計取決于將要處理的原水和處理后產(chǎn)水用途，收集系統(tǒng)設(shè)計資料及原水分析報告。

第2步：選擇系統(tǒng)排列和級數(shù)

    常規(guī)的水處理系統(tǒng)排列結(jié)構(gòu)為進水一次通過式，而在較小的系統(tǒng)中采甩濃水循環(huán)排列 結(jié)構(gòu)，例如多數(shù)的商用水處理系統(tǒng)（超純水系統(tǒng)）；所需元件數(shù)量較少的有一定規(guī)模的系統(tǒng)，采用進水一次通過式難以達到足夠的系統(tǒng)回收率時，也采用濃水循環(huán)排列結(jié)構(gòu)；在特殊應(yīng)用領(lǐng)域如工藝物料濃縮和廢水處理，通常采用濃水循環(huán)排列系統(tǒng)。

      RO/NF系統(tǒng)通常采用連續(xù)運行方式，系統(tǒng)中的每一支膜元件的運行條件不隨時間變化，但在某些應(yīng)用情況下，如廢水處理或工藝物料的濃縮或當供水量小較小且供水不連續(xù)時，選用分批處理操作系統(tǒng)，此時，進水收集在原水箱中，然后進行循環(huán)處理，部分批處理操作是分批處理操作的改良，在操作運行過程期間，不斷向原水箱注入原水。

    多級處理(兩級)系統(tǒng)是兩個傳統(tǒng)RO/NF系統(tǒng)的組合工藝，級的產(chǎn)水作為第二級的進水，每一級既可以是單段式或也可以是多段式，既可以是原水一次通過式也可以是濃水再循環(huán)式。制藥和醫(yī)藥用水的生產(chǎn)常選用產(chǎn)水多級處理工藝。若想取代第二級膜系統(tǒng)，可以考慮采用離子交換工藝。  

第3步：膜元件的選擇

    根據(jù)進水含鹽量、進水污染可能、所需系統(tǒng)脫鹽率、產(chǎn)水量和能耗要求來選擇膜元件，當系統(tǒng)產(chǎn)水量大于10gpm (2.3M³/h)時，選用直徑為8英寸長度為40英寸的膜元件，當系統(tǒng)較小時則選用小型元件。當要求*產(chǎn)水水質(zhì)時，通常使用離子交換樹指對RO/NF產(chǎn)水進行深度處理。